Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFIH1Q9BYX4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFIH1Q9BYX4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms