Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms