Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPL3Q9BY60 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPL3Q9BY60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms