Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms