Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA7Q9BWT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDCA7Q9BWT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDCA7Q9BWT1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms