Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2Q9BSQ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2Q9BSQ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms