Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCGF1Q9BSM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms