Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF8Q9BRL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms