Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MESP1Q9BRJ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms