Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCAPGQ9BPX3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPGQ9BPX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms