Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF15Q99988 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms