Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUSP9Q99956 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP9Q99956 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms