Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRG3Q99928 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRG3Q99928 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms