Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTRCQ99895 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTRCQ99895 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms