Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRX2Q99811 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRRX2Q99811 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRRX2Q99811 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms