Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORT1Q99523 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms