Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPK1Q96SB4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK1Q96SB4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK1Q96SB4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK1Q96SB4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK1Q96SB4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK1Q96SB4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK1Q96SB4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms