Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCC1Q96RQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCC1Q96RQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms