Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALS2Q96Q42 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ALS2Q96Q42 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms