Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMG1Q96Q15 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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