Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00052Q96N35 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms