Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NSMCE2Q96MF7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NSMCE2Q96MF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms