Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM47Q96LD4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM47Q96LD4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms