Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCZQ96LD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCZQ96LD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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