Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKNOX2Q96KN3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKNOX2Q96KN3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms