Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM8Q96KF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms