Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87BQ96K49 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87BQ96K49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms