Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMX3Q96JJ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMX3Q96JJ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms