Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCPIP1Q96JH7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCPIP1Q96JH7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms