Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC12Q96J65 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms