Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSANTD3Q96H12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSANTD3Q96H12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms