Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APIPQ96GX9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APIPQ96GX9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
APIPQ96GX9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APIPQ96GX9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms