Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BICD1Q96G01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BICD1Q96G01 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms