Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP6Q96FZ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP6Q96FZ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms