Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDC3Q96F86 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms