Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39LQ96EH5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms