Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3CQ96E17 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB3CQ96E17 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.2 ms