Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMIM19Q96E16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms