Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCTD12Q96CX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCTD12Q96CX2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCTD12Q96CX2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms