Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYTL4Q96C24 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYTL4Q96C24 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL4Q96C24 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms