Protein–RNA interactions for Protein: Q96B02

UBE2W, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2WQ96B02 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2WQ96B02 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2WQ96B02 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms