Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB7BQ96AH8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms