Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM63Q969Q1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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