Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNPO1Q92973 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms