Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms