Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRAT1Q92837 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
FRAT1Q92837 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRAT1Q92837 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms