Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN4Q92575 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBXN4Q92575 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms