Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPDL3AQ92484 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms