Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSMEM1Q8WWF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms