Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TSKUQ8WUA8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms